Dottorato di Ricerca in Biochimica e Biotecnologie
All’inizio del mio dottorato mi sono dedicata allo studio delle caratteristiche biofisiche e biochimiche dell’Apparato Fotosintetico ed ho aumentato le mie conoscenze di biochimica delle proteine collaborando a vari progetti del gruppo con l’incarico di progettare e realizzare esperimenti e di occuparmi della loro messa a punto e della risoluzione dei problemi. In questo periodo ho manifestato inoltre crescente interesse per la ricerca riguardo allo sfruttamento dell’energia solare attraverso la coltivazione di organismi fotosintetici e pertanto mi è stata data la possibilità di lavorare ad un progetto del gruppo che riguardava la produzione di biodiesel a partire da biomassa microalgale.
Grazie ad un corso per dottorandi riguardo ai sequenziatori di nuova generazione ed alle loro applicazioni tenuto dal Professor Valle, ho avuto l’idea di studiare il genoma e il trascrittoma dell’alga Nannochloropsis al fine di individuare i geni responsabili per l’accumulo dell’olio all’interno delle cellule e di produrre i dati necessari ad aprire una prospettiva di modificazione genetica di questo organismo. Nel 2009 ho iniziato a lavorare al sequenziamento del genoma e del trascrittoma di Nannochloropsis gaditana in stretta collaborazione con il gruppo del Professor Giorgio Valle e con il gruppo del Dottor Tomas Morosinotto.
I risultati delle mie ricerche sono stati la sequenza completa del genoma di Nannochloropsis gaditana assemblato quasi a livello dei singoli cromosomi e il profilo dell’espressione genica di Nannochloropsis gaditana in condizioni di accumulo di olio comparate con condizioni di crescita normale (poco olio all’interno delle cellule).
La descrizione completa dei miei esperimenti e dei risultati che hanno dato è riportata nella mia tesi di Dottorato.
A seguito dell’analisi dei dati genomici e tracsrittomici di N. gaditana ho descritto i dati e le mie conclusioni in una pubblicazione.
Inoltre, insieme ai ricercatori del team di Bioinformatica del CRIBI dell’Università di Padova ho lavorato al rilascio di una risorsa web per l’accesso e l’analisi dei dati del genoma di Nannochloropsis ed abbiamo anche aperto un blog per incoraggiare la comunicazione e la collaborazione fra gli scienziati che operano in questo campo della ricerca.